Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ESCO2Q56NI9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ESCO2Q56NI9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms