Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms