Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSD17B12Q53GQ0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms