Protein–RNA interactions for Protein: Q53GI3

ZNF394, Zinc finger protein 394, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394Q53GI3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF394Q53GI3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms