Protein–RNA interactions for Protein: Q496J9

SV2C, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2CQ496J9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SV2CQ496J9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SV2CQ496J9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms