Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EDRF1Q3B7T1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms