Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HFEQ30201 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HFEQ30201 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HFEQ30201 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HFEQ30201 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HFEQ30201 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HFEQ30201 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HFEQ30201 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HFEQ30201 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HFEQ30201 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HFEQ30201 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HFEQ30201 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HFEQ30201 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HFEQ30201 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HFEQ30201 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HFEQ30201 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HFEQ30201 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HFEQ30201 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HFEQ30201 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HFEQ30201 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HFEQ30201 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HFEQ30201 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HFEQ30201 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HFEQ30201 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HFEQ30201 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HFEQ30201 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HFEQ30201 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HFEQ30201 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HFEQ30201 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HFEQ30201 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HFEQ30201 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HFEQ30201 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HFEQ30201 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HFEQ30201 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HFEQ30201 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HFEQ30201 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HFEQ30201 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HFEQ30201 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HFEQ30201 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HFEQ30201 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HFEQ30201 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HFEQ30201 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HFEQ30201 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HFEQ30201 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HFEQ30201 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HFEQ30201 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HFEQ30201 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HFEQ30201 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HFEQ30201 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HFEQ30201 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HFEQ30201 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HFEQ30201 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HFEQ30201 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HFEQ30201 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HFEQ30201 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HFEQ30201 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HFEQ30201 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HFEQ30201 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HFEQ30201 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HFEQ30201 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HFEQ30201 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HFEQ30201 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HFEQ30201 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HFEQ30201 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HFEQ30201 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HFEQ30201 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HFEQ30201 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HFEQ30201 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HFEQ30201 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HFEQ30201 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HFEQ30201 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HFEQ30201 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HFEQ30201 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HFEQ30201 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HFEQ30201 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HFEQ30201 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HFEQ30201 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HFEQ30201 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HFEQ30201 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HFEQ30201 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HFEQ30201 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HFEQ30201 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HFEQ30201 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HFEQ30201 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HFEQ30201 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HFEQ30201 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HFEQ30201 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HFEQ30201 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HFEQ30201 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HFEQ30201 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HFEQ30201 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HFEQ30201 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HFEQ30201 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HFEQ30201 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HFEQ30201 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HFEQ30201 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HFEQ30201 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HFEQ30201 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HFEQ30201 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HFEQ30201 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms