Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UVSSAQ2YD98 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms