Protein–RNA interactions for Protein: Q2Y0W8

SLC4A8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A8Q2Y0W8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
SLC4A8Q2Y0W8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC4A8Q2Y0W8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A8Q2Y0W8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A8Q2Y0W8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A8Q2Y0W8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A8Q2Y0W8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A8Q2Y0W8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A8Q2Y0W8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A8Q2Y0W8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A8Q2Y0W8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A8Q2Y0W8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A8Q2Y0W8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms