Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC6LQ2NKX8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms