Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KNOP1Q1ED39 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
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