Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GEN1Q17RS7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GEN1Q17RS7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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