Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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