Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PCSK7Q16549 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCSK7Q16549 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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