Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NTRK3Q16288 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
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