Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN9AQ15858 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
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