Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
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