Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SURF1Q15526 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SURF1Q15526 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
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