Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PRKD1Q15139 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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PRKD1Q15139 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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PRKD1Q15139 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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PRKD1Q15139 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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PRKD1Q15139 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
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