Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX17Q15036 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
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