Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IKBKEQ14164 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
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