Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE7AQ13946 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE7AQ13946 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE7AQ13946 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE7AQ13946 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE7AQ13946 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE7AQ13946 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE7AQ13946 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE7AQ13946 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE7AQ13946 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE7AQ13946 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE7AQ13946 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE7AQ13946 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE7AQ13946 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE7AQ13946 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE7AQ13946 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE7AQ13946 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE7AQ13946 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE7AQ13946 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE7AQ13946 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE7AQ13946 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE7AQ13946 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE7AQ13946 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE7AQ13946 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE7AQ13946 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE7AQ13946 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE7AQ13946 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE7AQ13946 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE7AQ13946 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE7AQ13946 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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