Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA9Q13797 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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