Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCOA4Q13772 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCOA4Q13772 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCOA4Q13772 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCOA4Q13772 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCOA4Q13772 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCOA4Q13772 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCOA4Q13772 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCOA4Q13772 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCOA4Q13772 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCOA4Q13772 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCOA4Q13772 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCOA4Q13772 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCOA4Q13772 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCOA4Q13772 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCOA4Q13772 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NCOA4Q13772 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCOA4Q13772 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCOA4Q13772 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCOA4Q13772 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NCOA4Q13772 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NCOA4Q13772 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NCOA4Q13772 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NCOA4Q13772 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCOA4Q13772 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCOA4Q13772 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCOA4Q13772 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCOA4Q13772 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCOA4Q13772 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCOA4Q13772 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCOA4Q13772 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCOA4Q13772 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCOA4Q13772 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCOA4Q13772 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NCOA4Q13772 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms