Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAPSNQ13702 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAPSNQ13702 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAPSNQ13702 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAPSNQ13702 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAPSNQ13702 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAPSNQ13702 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAPSNQ13702 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAPSNQ13702 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAPSNQ13702 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAPSNQ13702 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAPSNQ13702 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAPSNQ13702 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAPSNQ13702 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAPSNQ13702 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAPSNQ13702 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAPSNQ13702 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAPSNQ13702 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAPSNQ13702 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAPSNQ13702 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAPSNQ13702 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAPSNQ13702 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RAPSNQ13702 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAPSNQ13702 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAPSNQ13702 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAPSNQ13702 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAPSNQ13702 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RAPSNQ13702 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAPSNQ13702 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAPSNQ13702 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAPSNQ13702 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAPSNQ13702 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAPSNQ13702 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAPSNQ13702 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAPSNQ13702 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAPSNQ13702 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAPSNQ13702 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAPSNQ13702 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms