Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms