Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRR1Q13601 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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