Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD4Q13485 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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