Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
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FOXE3Q13461 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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