Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNTA1Q13424 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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SNTA1Q13424 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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SNTA1Q13424 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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SNTA1Q13424 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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