Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDE3BQ13370 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
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