Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA3BQ13214 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
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