Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALCOCO2Q13137 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALCOCO2Q13137 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms