Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXF2Q12947 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXF2Q12947 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXF2Q12947 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXF2Q12947 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXF2Q12947 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXF2Q12947 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXF2Q12947 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXF2Q12947 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXF2Q12947 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXF2Q12947 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXF2Q12947 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXF2Q12947 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXF2Q12947 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXF2Q12947 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXF2Q12947 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXF2Q12947 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXF2Q12947 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXF2Q12947 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXF2Q12947 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXF2Q12947 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXF2Q12947 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXF2Q12947 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXF2Q12947 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXF2Q12947 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXF2Q12947 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXF2Q12947 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXF2Q12947 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXF2Q12947 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXF2Q12947 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXF2Q12947 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXF2Q12947 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXF2Q12947 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXF2Q12947 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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