Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
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