Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 YDR222WYDR222W 1248 nt3.1□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 USE1YGL098W 738 nt3.1□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 LSM1YJL124C 519 nt3.1□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 RPS21AYKR057W 264 nt3.1□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt3.1□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt3.1□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 ERG9YHR190W 1335 nt3.1□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 SUP45YBR143C 1314 nt3.1□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 RAD5YLR032W 3510 nt3.1□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 STE23YLR389C 3084 nt3.09□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 YEL025CYEL025C 3567 nt3.09□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 MIT1YEL007W 2001 nt3.09□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 YDL162CYDL162C 357 nt3.09□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 YDL176WYDL176W 2127 nt3.09□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt3.09□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 COX23YHR116W 456 nt3.09□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 DLS1YJL065C 504 nt3.09□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 EBP2YKL172W 1284 nt3.09□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 USB1YLR132C 873 nt3.09□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 TEX1YNL253W 1269 nt3.09□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 CAF20YOR276W 486 nt3.09□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 RPA43YOR340C 981 nt3.09□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 YPR136CYPR136C 513 nt3.09□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 CMD1YBR109C 444 nt3.09□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 CTM1YHR109W 1758 nt3.09□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 YPL109CYPL109C 1974 nt3.09□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 NOP4YPL043W 2058 nt3.08□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 FRE4YNR060W 2160 nt3.08□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 SKN7YHR206W 1869 nt3.08□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 YDL186WYDL186W 834 nt3.08□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 YHP1YDR451C 1062 nt3.08□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 YGR026WYGR026W 837 nt3.08□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 GTT1YIR038C 705 nt3.08□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 OMA1YKR087C 1038 nt3.08□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 MUM2YBR057C 1101 nt3.08□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 HDA2YDR295C 2025 nt3.08□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 NTO1YPR031W 2247 nt3.08□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 PLM2YDR501W 1566 nt3.08□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 TMA108YIL137C 2841 nt3.07□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 RPL30YGL030W 318 nt3.07□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 MTM1YGR257C 1101 nt3.07□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt3.07□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 RPS10BYMR230W 318 nt3.07□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 CPR8YNR028W 927 nt3.07□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 HUB1YNR032C-A 222 nt3.07□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 IZH2YOL002C 954 nt3.07□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 YPR078CYPR078C 1119 nt3.07□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt3.07□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 TRM12YML005W 1389 nt3.07□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 MIG1YGL035C 1515 nt3.07□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 POL3YDL102W 3294 nt3.06□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 YDL242WYDL242W 354 nt3.06□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 FRQ1YDR373W 573 nt3.06□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt3.06□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 PCI8YIL071C 1335 nt3.06□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 MRPL49YJL096W 486 nt3.06□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 DRS2YAL026C 4068 nt3.06□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 RPS28BYLR264W 204 nt3.06□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt3.06□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 YOR296WYOR296W 3870 nt3.06□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 YPR142CYPR142C 564 nt3.06□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 PIN3YPR154W 648 nt3.06□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 SIN4YNL236W 2925 nt3.06□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 RCY1YJL204C 2523 nt3.05□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 YHR202WYHR202W 1809 nt3.05□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 AEP3YPL005W 1821 nt3.05□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 ARP4YJL081C 1470 nt3.05□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 DTD1YDL219W 453 nt3.05□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 KEG1YFR042W 603 nt3.05□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 KXD1YGL079W 657 nt3.05□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 RPL19BYBL027W 570 nt3.05□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 SUR1YPL057C 1149 nt3.05□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 snR42snR42 351 nt3.05□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 BMS1YPL217C 3552 nt3.05□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 CAF130YGR134W 3369 nt3.05□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 CPA2YJR109C 3357 nt3.04□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 CIN8YEL061C 3003 nt3.04□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 CDC40YDR364C 1368 nt3.04□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 MDM1YML104C 3384 nt3.04□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 ENA2YDR039C 3276 nt3.04□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 ENA1YDR040C 3276 nt3.04□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 BSC2YDR275W 708 nt3.04□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 YDR340WYDR340W 303 nt3.04□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 IZH1YDR492W 951 nt3.04□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 ISC10YER180C 804 nt3.04□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 AML1YGR001C 747 nt3.04□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 RPL17AYKL180W 555 nt3.04□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 YMR178WYMR178W 825 nt3.04□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 IRC14YOR135C 342 nt3.04□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 YSP2YDR326C 4317 nt3.04□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 UBP5YER144C 2418 nt3.04□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 YDL180WYDL180W 1644 nt3.04□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 ISM1YPL040C 3009 nt3.03□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 ACK1YDL203C 1872 nt3.03□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 AEP2YMR282C 1743 nt3.03□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt3.03□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 PAN5YHR063C 1140 nt3.03□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 MTD1YKR080W 963 nt3.03□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 ERP1YAR002C-A 660 nt3.03□□□□□ -1.92
RRP42Q12277 SIC1YLR079W 855 nt3.03□□□□□ -1.92
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