Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 NGL2YMR285C 1548 nt5.43□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 RTC5YOR118W 1704 nt5.43□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 CDC55YGL190C 1581 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 SKN1YGR143W 2316 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 YFR006WYFR006W 1608 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 YHL018WYHL018W 363 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 YJL015CYJL015C 285 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 SMA2YML066C 1110 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 ARG80YMR042W 534 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 MRM1YOR201C 1239 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 YBR090CYBR090C 369 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 YBR124WYBR124W 360 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 GUD1YDL238C 1470 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 TRP5YGL026C 2124 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 NUP1YOR098C 3231 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 NOT3YIL038C 2511 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 HXT4YHR092C 1731 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 KEX2YNL238W 2445 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 RPE1YJL121C 717 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 PAU17YLL025W 375 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 ISF1YMR081C 1017 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 SHP1YBL058W 1272 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 RPL18AYOL120C 561 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 YPR077CYPR077C 372 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 UBP6YFR010W 1500 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 BRE2YLR015W 1518 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 DIA3YDL024C 1407 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 AMA1YGR225W 1782 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 YCR013CYCR013C 648 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 SPO73YER046W 432 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 YJL220WYJL220W 453 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 YLR031WYLR031W 561 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 YNL338WYNL338W 159 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 RPS19AYOL121C 435 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 YOR121CYOR121C 306 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 DGK1YOR311C 873 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 INA17YPL099C 549 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-BLQ12266 PTK2YJR059W 2457 nt5.4□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 PCS60YBR222C 1632 nt5.4□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 TMN2YDR107C 2019 nt5.4□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 ATG1YGL180W 2694 nt5.4□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 HAA1YPR008W 2085 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 TDA7YNL176C 1911 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 SRP1YNL189W 1629 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 YCR101CYCR101C 549 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 YET3YDL072C 612 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 HNT1YDL125C 477 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 GCS1YDL226C 1059 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 YGL108CYGL108C 423 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 YPT32YGL210W 669 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 MIC26YGR235C 702 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 YJR128WYJR128W 360 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 YKL044WYKL044W 321 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 YML018CYML018C 1182 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 RRP9YPR137W 1722 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 STE5YDR103W 2754 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 BUD7YOR299W 2241 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 EXO5YBR163W 1758 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 ADY2YCR010C 852 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 MAK31YCR020C-A 267 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 YER023C-AYER023C-A 213 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 YER079C-AYER079C-A 339 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 YIR020CYIR020C 303 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 SCS7YMR272C 1155 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 YMR295CYMR295C 594 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 POP3YNL282W 588 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 YOR203WYOR203W 354 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 snR48snR48 113 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 PMS1YNL082W 2622 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 ERG1YGR175C 1491 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 RIM21YNL294C 1602 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 MED1YPR070W 1701 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 BNA6YFR047C 888 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 QNS1YHR074W 2145 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 LCL2YLR104W 396 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 YML031C-AYML031C-A 336 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 YBL055CYBL055C 1257 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 YPR039WYPR039W 336 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 SNF12YNR023W 1701 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 KKQ8YKL168C 2175 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 SDH6YDR379C-A 240 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 CYC7YEL039C 342 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 JAC1YGL018C 555 nt5.36□□□□□ -1.55
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