Protein–RNA interactions for Protein: Q12217

TY1A-BR, Transposon Ty1-BR Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BRQ12217 THR1YHR025W 1074 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 YKL070WYKL070W 510 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 RHO4YKR055W 876 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 ATP14YLR295C 375 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 YLR434CYLR434C 384 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 PAI3YMR174C 207 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 TRM112YNR046W 408 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 TUF1YOR187W 1314 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 ERG1YGR175C 1491 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 DAL5YJR152W 1632 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 YER023C-AYER023C-A 213 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 RPL1BYGL135W 654 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 REE1YJL217W 597 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 EMC2YJR088C 879 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 YLL044WYLL044W 447 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 COX5AYNL052W 462 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 YNL092WYNL092W 1203 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 RPL1AYPL220W 654 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 snR36snR36 182 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 BRN1YBL097W 2265 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 STB5YHR178W 2232 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 HSP82YPL240C 2130 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 SWC4YGR002C 1431 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 DPB4YDR121W 591 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 GLO2YDR272W 825 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 BSC2YDR275W 708 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 CYC7YEL039C 342 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 VMA10YHR039C-A 345 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 CDC42YLR229C 576 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 ICY1YMR195W 384 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 RMI1YPL024W 726 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 ESC8YOL017W 2145 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 TPO3YPR156C 1869 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 VAN1YML115C 1608 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 YBR139WYBR139W 1527 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 TRE1YPL176C 2352 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 MPC3YGR243W 441 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 ATG36YJL185C 882 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 RUF23RUF23 254 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 TOS6YNL300W 309 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 DGK1YOR311C 873 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 YPR098CYPR098C 486 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 VHT1YGR065C 1782 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 ASF2YDL197C 1578 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 MSS1YMR023C 1581 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 ZPR1YGR211W 1461 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 CUE3YGL110C 1875 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 SIA1YOR137C 1869 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 AIM3YBR108W 2844 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 API2YDR525W 330 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 ECO1YFR027W 846 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 NBL1YHR199C-A 222 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 COA1YIL157C 594 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 YJR012CYJR012C 624 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 YOR331CYOR331C 558 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 GIP1YBR045C 1920 nt5.84□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 SIS2YKR072C 1689 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 YCR007CYCR007C 720 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 YDR102CYDR102C 333 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 YJL144WYJL144W 315 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 MRPL38YKL170W 417 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 ERG3YLR056W 1098 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 PFK2YMR205C 2880 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 YNR063WYNR063W 1824 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 TOG1YER184C 2385 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 PSA1YDL055C 1086 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 CDC36YDL165W 576 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 CBR1YIL043C 855 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 YJL160CYJL160C 864 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 SUE1YPR151C 621 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 ECM3YOR092W 1842 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 AFG1YEL052W 1530 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 HPR1YDR138W 2259 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 GEX2YKR106W 1848 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 TUB3YML124C 1338 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 ARP5YNL059C 2268 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 PEP7YDR323C 1548 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 YDR431WYDR431W 312 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 PPM1YDR435C 987 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 SDH7YDR511W 402 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 PMI40YER003C 1290 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 YJL213WYJL213W 996 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 YNL338WYNL338W 159 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 FRM2YCL026C-A 582 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 ZUO1YGR285C 1302 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 HRD1YOL013C 1656 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 JAC1YGL018C 555 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 THI4YGR144W 981 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 TDH3YGR192C 999 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 LSO1YJR005C-A 282 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 TDH2YJR009C 999 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 LCL2YLR104W 396 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 MRPL19YNL185C 477 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 MET31YPL038W 534 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 YCL023CYCL023C 348 nt5.8□□□□□ -1.48
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