Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 YDR340WYDR340W 303 nt3.6□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 YER138W-AYER138W-A 105 nt3.6□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 YJR128WYJR128W 360 nt3.6□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 AHP1YLR109W 531 nt3.6□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt3.6□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 RRP36YOR287C 903 nt3.6□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 RSC1YGR056W 2787 nt3.6□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 RNT1YMR239C 1416 nt3.6□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 NSP1YJL041W 2472 nt3.6□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 HDA2YDR295C 2025 nt3.6□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 NHP10YDL002C 612 nt3.59□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 QRI7YDL104C 1224 nt3.59□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 YDR124WYDR124W 975 nt3.59□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 RPA14YDR156W 414 nt3.59□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 YGR168CYGR168C 1131 nt3.59□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 YHR022CYHR022C 771 nt3.59□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 MAK16YAL025C 921 nt3.59□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 YJR056CYJR056C 711 nt3.59□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 SOD1YJR104C 465 nt3.59□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 PML39YML107C 1005 nt3.59□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 IMP4YNL075W 873 nt3.59□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 TRM112YNR046W 408 nt3.59□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 ATG19YOL082W 1248 nt3.59□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 PNO1YOR145C 825 nt3.59□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 SHQ1YIL104C 1524 nt3.59□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 RPS8BYER102W 603 nt3.58□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 YGR190CYGR190C 366 nt3.58□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 BMT5YIL096C 1011 nt3.58□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 MRPS8YMR158W 468 nt3.58□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 RPS8AYBL072C 603 nt3.58□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 TIR2YOR010C 756 nt3.58□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 ICS2YBR157C 768 nt3.58□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 HEF3YNL014W 3135 nt3.58□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 PBI1YPL272C 1554 nt3.58□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 YLR352WYLR352W 2424 nt3.58□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 ALA1YOR335C 2877 nt3.57□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 RAD5YLR032W 3510 nt3.57□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 RAD55YDR076W 1221 nt3.57□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 HIM1YDR317W 1245 nt3.57□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 RRP17YDR412W 708 nt3.57□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 YFL051CYFL051C 483 nt3.57□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 AML1YGR001C 747 nt3.57□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 TAF1YGR274C 3201 nt3.57□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 GTT1YIR038C 705 nt3.57□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 GCD14YJL125C 1152 nt3.57□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 YJR061WYJR061W 2808 nt3.57□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt3.57□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 HUB1YNR032C-A 222 nt3.57□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 YNR066CYNR066C 1311 nt3.57□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 PIN3YPR154W 648 nt3.57□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 RSF2YJR127C 4143 nt3.57□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 AEP2YMR282C 1743 nt3.56□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 TEC1YBR083W 1461 nt3.56□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 RDS2YPL133C 1341 nt3.56□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 TSC13YDL015C 933 nt3.56□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 YDL162CYDL162C 357 nt3.56□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt3.56□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 PRP18YGR006W 756 nt3.56□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 ECM4YKR076W 1113 nt3.56□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 ERP1YAR002C-A 660 nt3.56□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 RIF2YLR453C 1188 nt3.56□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 LDS2YOL047C 1071 nt3.56□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 RPS10AYOR293W 318 nt3.56□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 YJR030CYJR030C 2238 nt3.56□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 SPA2YLL021W 4401 nt3.56□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 ECM18YDR125C 1362 nt3.55□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 RPS29BYDL061C 171 nt3.55□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 YFL065CYFL065C 309 nt3.55□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 TAN1YGL232W 870 nt3.55□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 BUR2YLR226W 1188 nt3.55□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 GSP1YLR293C 660 nt3.55□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 RDN58-1RDN58-1 158 nt3.55□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 RDN58-2RDN58-2 158 nt3.55□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 RAD14YMR201C 1116 nt3.55□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 DUG3YNL191W 1074 nt3.55□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 ASI1YMR119W 1875 nt3.55□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 ETP1YHL010C 1758 nt3.55□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 BYE1YKL005C 1785 nt3.55□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 MON1YGL124C 1935 nt3.54□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 SLI1YGR212W 1407 nt3.54□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 SUP45YBR143C 1314 nt3.54□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 MGT1YDL200C 567 nt3.54□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 GIC2YDR309C 1152 nt3.54□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 YGL138CYGL138C 1038 nt3.54□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 EPT1YHR123W 1176 nt3.54□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 CFD1YIL003W 882 nt3.54□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 YIL024CYIL024C 570 nt3.54□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 ANB1YJR047C 474 nt3.54□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 YIP3YNL044W 531 nt3.54□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 SNT1YCR033W 3681 nt3.54□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 PLP1YDR183W 693 nt3.53□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 YDR535CYDR535C 501 nt3.53□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt3.53□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 KXD1YGL079W 657 nt3.53□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 PFS1YHR185C 714 nt3.53□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 SED5YLR026C 1023 nt3.53□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 IZH2YOL002C 954 nt3.53□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 FIG1YBR040W 897 nt3.53□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 DAN4YJR151C 3486 nt3.53□□□□□ -1.84
VPS54Q12071 MRS2YOR334W 1413 nt3.53□□□□□ -1.85
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