Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LMOD3Q0VAK6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMOD3Q0VAK6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms