Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms