Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4DQ08499 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4DQ08499 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms