Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms