Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
COL16A1Q07092 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms