Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms