Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEUP1Q05D60 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEUP1Q05D60 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms