Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CALD1Q05682 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms