Protein–RNA interactions for Protein: Q05048

CSTF1, Cleavage stimulation factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF1Q05048 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSTF1Q05048 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSTF1Q05048 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSTF1Q05048 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSTF1Q05048 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSTF1Q05048 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSTF1Q05048 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSTF1Q05048 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSTF1Q05048 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSTF1Q05048 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CSTF1Q05048 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSTF1Q05048 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSTF1Q05048 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTF1Q05048 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTF1Q05048 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTF1Q05048 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTF1Q05048 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTF1Q05048 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTF1Q05048 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTF1Q05048 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTF1Q05048 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTF1Q05048 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTF1Q05048 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTF1Q05048 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTF1Q05048 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTF1Q05048 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTF1Q05048 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTF1Q05048 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTF1Q05048 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTF1Q05048 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTF1Q05048 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTF1Q05048 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTF1Q05048 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSTF1Q05048 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSTF1Q05048 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSTF1Q05048 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSTF1Q05048 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms