Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms