Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF85Q03923 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF85Q03923 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF85Q03923 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF85Q03923 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF85Q03923 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF85Q03923 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF85Q03923 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF85Q03923 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF85Q03923 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF85Q03923 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms